1. Muu não fica intangível, ou seja, ele possui forma. Você confundiu a fama do cara com o seu poder, um erro semelhante a dizer que Minato possui um raiton amarelo, devido a sua fama.
2. Quando Muu ficou invisível, o próprio Onoki afirma para que o sensoriais fiquem espertos. Isso por si só demonstra que eventualmente é possível localizar a posição do Muu através do sensor.
Eis o databook da técnica Mujin Mensai:
Mujin Meisai
Ninjutsu – Suplementar – Rank B
Usuários: Mu
Tomando para si a aparência de nada, se transformando no céu. Uma técnica de invisibilidade como a Lua em uma noite chuvosa.
Água muda a aparência de tudo, seja algo gasoso ou sólido,
às vezes ela distrai a luz, às vezes ela refrata a luz como um prisma, imitando uma miragem. O ponto forte de Mu é a manipulação da água, especificamente ele doma a luz. Se revestindo de gotículas de água, o usuário do jutsu “Mujin Meisai” escapa da luz, apagando sua aparência. Como água, ele se torna uma existência que não existe...
→↓Ao refratar a luz próxima a si por meio da água, o usuário consegue fingir que não está no local. A mecânica é similar à camuflagem ótica.
3. A única diferença entre o Meisaigakure e o Mujin Meisai, é que o jutsu do Muu usa o Suiton para manipular a luz, no entanto como afirmado no databook e demonstrado no mangá esse tipo de ilusão é inutil contra o Sharingan ou Byakugan (eu adicionaria também o rinnegan).
Provavelmente tenha sido por isso que Madara conseguiu vencer Muu e Onoki juntos, usando apenas o seu Mangekyo Sharingan.
Mesmo que sensores podem falhar em dectar o Muu, devido ao efeito da refração do chackra, Muu ainda pode ser detectado tempestivamente caso tente atacar um clone, caso tente usar algum ninjutsu.
Embora eu não tenha encontrado no mangá, por qual motivo o chackra do Muu não pode ser detectado.