Como já disseram, a história toda aponta pra isso. Entretanto, tem alguns pontos que acredito serem negativos à essa tese, que ao meu ver torna esse futuro não tão claro por enquanto.
Para que o Tomura possa bater de frente contra o Deku, é necessário que ele tenha um poder que fortaleça suas habilidades físicas. Não acredito que o All For One seja uma possibilidade, pois ter uma segunda geração de All for One vs One For All seria mais do mesmo. O Shigaraki não é como seu Mestre em carisma e frieza, ele é mais o tipo de vilão fanático/louco, que age de forma aleatória (poderia ser como um Coringa no futuro). Além disso, já vimos que o All for One (habilidade) não é mais suficiente para bater de frente com o One For All nessa geração. Sendo assim, fica em aberto quais habilidades o vilão poderá ter.
Também há o fator motivação. Eu não vejo esse vilão todo no Shigaraki e não é pelo fato dele ainda ser um "aprendiz", mas por não ter um motivo claro pelo seus atos. Ele é louco e odeia os heróis. Posso estar enganado por não saber todos os detalhes do seu passado, mas acredito que seja necessário mais "alguma coisa" acontecer com ele.
Não me entendam mal, eu sei que ele é só um projeto de vilão assim como o Deku é um de herói. Mas a evolução do Deku, tanto física quanto mental, tem sido bem clara e constante na história, enquanto não vejo evolução do Tomura, e ressalto aqui a evolução mental do personagem.
Portanto, não descarto que Shigaraki Tomura seja o vilão final pelos motivos que já apontaram neste tópico, mas atualmente ele não possui objetivo e habilidade suficientes e sequer mostra evolução. Não temos uma dica se ele irá ter esses dois no futuro e quais serão. Fica então a expectativa, mas por enquanto é só o que temos.