Os Dominadores usaram tal termo para descrever qualquer nativo humano da Terra com "habilidades fictícias sobre-humanas". O prefixo grego meta, de acordo com o dicionário Houaiss eletrônico, é definido, entre outras acepções, como "mudança de lugar ou de condição" (como metamorfose, metafísica, metapsíquica etc).
Ele vai ser as duas coisas.
Por exemplo.
Jon Kent, filho do Superman com Lois Lane, ele é nativo da terra, porém tem DNA alien e tem super poderes, logo, ele é tanto um mutante do ponto de vista humano, quanto um meta humano por possuir habilidades super humanas.
Tanto meta humanos, quanto mutantes, são nativos da terra, que sofreram uma mudança em seu DNA.
Na Marvel todos são potenciais mutantes, mas nem todos despertam os poderes, mas todos possuem o gene X se me lembro bem.